Медицинская информационная система (МИС) — система автоматизации документооборота для медицинских учреждений, в которой объединены система поддержки принятия врачебных решений, электронные медицинские карты пациентов, данные медицинских исследований в цифровой форме, данные мониторинга состояния пациента с медицинских приборов, средства общения между сотрудниками, финансовая и административная информация.

МИСами обычно используется стандарт передачи данных HL7, Health Level 7, описывающий процедуры и механизмы обмена, управления и интеграции электронной медицинской информации. Существует несколько подходов к классификации медицинских информационных систем. Первый основан на технологическом устройстве цифровой платформы. Он описывает, каким предельным функционалом обладает каждая конкретная разработка МИС.

Второй подход определяет виды информационных систем применительно к сложившейся структуре отрасли здравоохранения, и их назначение. Согласно ему, выделяют четыре организационных уровня: базовый, учреждение, территориальный и государственный.

МИС базового уровня – это информационные системы, которые используют доктора в своей ежедневной практике. Они оказывают информационную, справочную, экспертную поддержку врачебной деятельности. Сюда же относят оборудование для проведения диагностических и лабораторных тестов, лечебного воздействия и автоматизированные рабочие места специалистов.